积极推行按人头付费、按病种付费和总额预付制，每个盟市选择2-3个旗县开展试点工作。进一步规范定点医疗机构和定点药店的服务行为，建立等级评价制度，推行分级管理和动态管理，强化新农合对医疗服务的监管作用，并逐步延伸到对医务人员行为的监管，依法查处欺诈骗保行为。积极探索建立新农合经办机构与医疗机构、药品供应商的谈判机制，探索委托具有资质的商业保险机构经办新农合，探索新农合与居民基本医疗保险制度管理与服务资源的有效利用。
二、加快建立国家基本药物制度
按照全覆盖、建机制的要求，建立规范基本药物采购机制，推进基层医疗卫生机构综合改革，实现新旧机制平稳转换。
继续扩大基本药物制度实施范围，实现基层全覆盖。全区政府办基层医疗卫生机构全部实施国家基本药物制度，全部配备和使用基本药物（含自治区增补药物），并实行零差率销售。实行“一体化”管理的嘎查村卫生室，全部实行基本药物制度。采取政府购买服务的方式，鼓励非政府办基层医疗卫生机构执行基本药物制度。同时，积极探索新一轮基本药物增补工作，兼顾成人和儿童用药，兼顾蒙药和中药，更好地适应基层基本用药需求。
建立和规范基本药物采购机制，重塑基层药品供应保障体系。在自治区政府统一组织下，实行基本药物集中采购、统一配送。一是实行量价挂钩。全区统一组织编制集中采购计划，明确采购数量。暂时无法确定采购数量的药品，通过单一货源承诺的方式进行采购。二是执行“双信封”招标制。只有经济技术标书评审合格的企业才能进入商务标书评审，商务标书评审由价格最低者中标。三是实行招采结合。受基层医疗卫生机构授权或委托，由自治区药械采购中心与药品供货企业签订购销合同，会同有关部门负责合同的执行，协调旗县市区国库收付中心统一支付药款。同时，采取由供货企业委托经营企业进行配送或自行配送的办法，确保基本药物生产供应。落实《内蒙古自治区医疗机构蒙药制剂调剂使用暂行办法》，保证蒙药医院制剂的供应和使用。
深化基层医疗卫生机构综合改革，建立适应基本药物制度的新机制。从“定机构、定编制、定职能”入手，加强政府办基层医疗卫生机构规划与管理，核实机构数量，核定人员编制，核准功能定位。继续推进乡村卫生服务和社区卫生服务一体化管理，提高基层医疗卫生机构整体服务能力。调整基层医疗卫生机构收费项目，合理确定收费标准，并调整新农合支付比例。探索建立稳定长效、多渠道的补偿机制，落实政府专项补助以及经常性收支差额补助。有条件的地区，积极推行收支两条线管理。健全绩效考核机制。根据工作数量、质量和服务对象满意度等指标，考核基层医疗卫生机构及医务人员。深化人事分配制度改革。全面建立人员聘用制度和岗位管理制度，完成基层医务人员竞聘上岗。全面落实绩效工资制度，调动医务人员积极性。
