第二十六条 省专项补助经费实行一次核定，分年度拨付。依托单位配套经费必须按照《任务书》确定的数额，及时到位；否则将停拨后续省专项建设补助经费。建设项目超预算部分，由依托单位自行筹措。
第二十七条 依托单位是重点研究基地建设经费的投入主体，必须至少按1：1配套省拨专项建设补助经费，每年的重点研究基地建设经费要列入单位年度预算。重点研究基地要通过技术开发、技术转让、技术咨询和技术服务等方式多渠道筹措建设经费，使每个强化建设的重点研究基地5年的建设经费理工农医类不低于800万元，人文社科类不低于200万元；使每个重点研究基地5年的建设经费理工农医类不低于400万元，人文社科类不低于100万元。重点研究基地用房面积理工农医类不低于2000平方米，人文社科类不低于300平方米。
第二十八条 依托单位应当对重点研究基地建设资金进行专户明细核算和管理，要建立健全财务管理制度，专款专用，学校不得提取管理费。其中用于硬件建设部分（如购置仪器设备、先进软件、图书资料等），理工农医类基地不低于70%，人文社科类基地不低于40%。基地建设形成的资产是国有资产，由依托单位统一管理使用。
第二十九条 重点研究基地建设经费的使用以提高使用效益和建设质量为前提，在国家财务制度允许的范围内尽量减少管理层次和繁杂手续。依托单位内审机构应加强对建设经费管理与使用情况的审计与监督。
第三十条 依托单位要对利用重点研究基地建设资金购置的仪器、设备等固定资产设立资产专户。
第三十一条 重点研究基地建设任务完成后，依托单位要继续为基地进一步发展和日常运行提供经费。
第五章 考核与评估
第三十二条 重点研究基地实行年度报告、中期评估和终期验收制度。
第三十三条 重点研究基地必须编制年度工作报告，经依托单位审核后，于每年1月31日前将上一年度的《山东省“十一五”高校重点实验室工作年报》（格式见附件3）、《山东省“十一五”高校人文社会科学研究基地工作年报》（格式见附件4）报送省教育厅。
