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研究制订《指导意见》实施方案的具体工作由省发展改革委总牵头，省各有关部门和单位共同参加。为进一步明确任务、落实责任，根据《指导意见》涉及的有关方面设立相应的专题材料起草组，各专题组由相关的主管部门牵头，省有关部门和单位配合，牵头部门可根据需要增加相关部门和单位。具体分工如下：
（一）综合组
由省发展改革委牵头，省委研究室、省政府研究室参加。
主要任务：负责起草贯彻落实《指导意见》的实施方案及有关联络协调。
（二）产业发展组
由省发展改革委、经贸委牵头，省科技厅、财政厅、交通厅、外经贸厅、信息产业厅、地税局、旅游局、金融办、南京海关、国税局参加。
主要任务：研究提出加快发展现代服务业，做强做大高新技术产业和优势支柱产业，优化产业空间布局，提升企业竞争力等方面的具体实施意见。
（三）统筹城乡发展组
由省农林厅牵头，省发展改革委、经贸委、财政厅、交通厅、建设厅、水利厅、劳动保障厅、金融办、海洋渔业局、农业资源开发局、供销社参加。
主要任务：研究提出大力发展现代农业，加快完善农业生产、经营、流通和服务体系，全面深化农村改革，稳步推进城乡一体化进程等方面的具体实施意见。
（四）自主创新组
由省科技厅牵头，省发展改革委、经贸委、财政厅、信息产业厅、教育厅、人事厅参加。
主要任务：研究提出构建具有国际竞争力的区域创新体系，实现关键领域和核心技术的创新突破，营造鼓励自主创新的政策环境，加强创新型人才的培养和引进等方面的具体实施意见。
（五）城镇体系组
由省建设厅牵头，省发展改革委、经贸委、交通厅、农林厅、水利厅、文化厅、环保厅参加。
主要任务：研究提出构建完备的城镇体系，完善和提升城市功能，提高城乡规划和建设管理水平等方面的具体实施意见。
（六）基础设施组
由省发展改革委牵头，省交通厅、水利厅、国土资源厅、信息产业厅、电力公司参加。
主要任务：研究提出完善综合交通运输体系，构建区域能源安全体系，改善水利基础设施，改进和健全信息基础设施等方面的具体实施意见。
（七）资源环境组
由省环保厅、国土资源厅牵头，省发展改革委、经贸委、农林厅、建设厅、海洋渔业局、农业资源开发局参加。
主要任务：研究提出提高土地节约和集约利用水平，推进节能降耗，强化环境保护和生态建设等方面的具体实施意见。
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