第十一条 资助项目协作经费，由受资助单位依据与项目协作单位签订的协作合同转拨。
第十二条 因故中止计划实施和撤销的资助项目，停止拨款。
第四章 管理与监督
第十三条 受资助单位必须指定专门银行帐号，按项目单独建帐，专款专用，按照本办法进行管理核算。
第十四条 项目负责人在本单位财务、科学基金项目管理部门的指导下，按计划自主支配使用资助经费，任何单位、个人无权截留、挪用。
第十五条 受资助单位应指定专人负责科学基金的财务管理工作，按项目并依据开支范围设立多栏式经费支出帐目。
第十六条 受资助单位或受资助项目负责人不按规定要求报送各类科学基金管理报表，或违反科学基金管理规定的，视情节可缓拨单位资助经费或资助项目经费。按规定予以纠正补报后，下半年补拨。逾期不补报、不纠正的，停止拨款。
第十七条 面上资助项目结束后三个月内，项目负责人应抓紧清理历年帐目，核实拨款与支出数字，严格按国家有关财政财务制度和本办法规定的开支范围，认真编报《国家自然科学基金项目资助经费决算表》（附件一），报受资助单位科学单位科学基金项目管理部门、财务部门审核，并由审计部门审计签署意见。
科学基金项目管理部门根据审核后的项目决算表，如实汇总编报《国家自然科学基金项目资助经费决算汇总表》（以下简称《汇总表》）（附件二）逐级签署审核意见报送科学基金委员会综合计划局批复决算。经科学基金委员会审核批复后，每年资助项目的《国家自然科学基金项目资助经费决算表》必须存入项目结题档案，以备检查。
重大、重点项目结束后六个月，课题负责人编报《国家自然科学基金项目资助经费决算表》一式两份报所在单位科学基金项目管理部门、财务部门、审计部门审核，审计签署意见盖章后，一份存入课题结题档案，一份送项目负责从统一汇总编报项目决算《汇总表》并签字报送科学基金委员会综合计划局审核批复后予以核销。不设课题的重点项目，按面上项目编报决算程序执行。
