第三条 小型农田水利专项资金重点支持小型水源、渠道、机电泵站等工程设施的修复、新建、续建与改造。对建设项目的材料费、设备费和施工机械作业费等给予补助。
中央财政根据财力可能、各省、自治区、直辖市，（以下简称各省）财政状况、小型农田水利工程建设任务、省级预算安排小型农田水利建设资金，以及以往年度项目实施情况，确定各省年度资金控制额度。
中央财政补助资金可用于中央补助项目的论证审查、规划编制、工程设计、技术咨询和信息服务支出，但最高比例不超过中央补助资金总额的3％（其中中央提取安排比例不超过1％），并不得用于人员补贴、购置交通工具和办公设备等支出。
第四条 中央财政积极探索建立小型农田水利专项资金“以奖代补”机制，通过“民办公助”增加补助小型农田水利建设专项资金的方式，对小型农田水利工程建设成效显著的地方实行“以奖代补”。
第五条 各级财政、水利部门共同组织和指导小型农田水利专项资金项目的实施。
第二章 项目申报和审批
第六条 申请中央财政补助资金的对象包括：
（一）农户（包括联户）。
（二）农民用水户协会或其他农民专业合作经济组织。
（三）村组集体。
第七条 申请对象向县级水利、财政部门申请项目时，应报送的文件材料包括：
（一）农户的基本情况、农民用水户协会或其他农民专业合作经济组织的基本资料；
（二）项目建设方案、资金筹措（含投劳）方案和建成后管护方案、用水分配方案，用水合作组织组建方案及村民有关决议材料。
第八条 县级水利部门会同财政部门，对农户、农民用水户协会或其他农民专业合作经济组织和村组集体的项目申请按以下原则进行审查：
（一）农户自愿的原则。充分尊重农民的意愿，调动农民参与建设和管理的积极性，项目建设的投劳投资方案和管理运行方式要经受益区农民民主议事、民主决策通过。
