第十八条 挤占、挪用农业综合开发资金，或者虚报农业综合开发项目的，根据《
财政违法行为处罚处分条例》及其它有关规定进行处理；对有偿资金未按期足额归还的，相应减少下年投资。
第四章 项目管理
第十九条 中央农口部门应依据国家农业综合开发政策和行业发展规划，制定部门项目建设规划和阶段性实施方案，并在此基础上做好项目申报前的准备工作。
第二十条 中央农口部门应于每年上半年，通过发布下一年度项目申报指南以及推行项目招商或项目招投标等多种形式，在较大范围内择优选项。
第二十一条 申报部门项目应提交可行性研究报告。可行性研究报告的格式与内容，由中央农口部门参照国家农发办关于编制地方农业综合开发项目可行性研究报告的要求确定。
第二十二条 部门项目由基层农口部门会同同级财政部门逐级向上申报。省级农口部门会同同级财政部门对项目可行性研究报告初审后，按申报要求和超过当年投资规模的一定比例，于项目实施年度上一年6月底前联合向中央农口部门申报项目可行性研究报告（属国家农发办评估审定的项目，其可行性研究报告应同时报国家农发办）。
未按要求进行联合申报或越级申报的项目，不予立项。
第二十三条 中型灌区节水配套改造、中央财政年度投资500万元（含）以上的土地治理项目和中央财政年度投资300万元（含）以上的产业化经营项目，由国家农发办评估审定；低于以上额度的项目由中央农口部门评估审定。国家农发办对中央农口部门项目评估审定工作进行指导、监督和检查。
项目评估应建立责任制，明确专业评估人员的评估责任。评估人员应对评估项目的技术可行性、经济合理性等作出客观真实的评价。因评估结论失实影响项目正确决策的，评估人员及其所属评估机构应承担相应责任。
第二十四条 中央农口部门应按照超过国家农发办当年下达的投资控制指标的一定比例，提前选好下年度拟扶持的备选项目。待国家农发办正式下达下一年度的部门项目投资控制总指标后，从备选项目中择优选项，并经与国家农发办事先协商在20个工作日内正式报国家农发办，同时附报项目评估审定情况。
