（二）流行病学调查
县级疾病预防控制机构接到疫情报告后，应及时开展流行病学调查。要对所有流脑病例和疑似病例开展个案调查，内容包括基本情况、临床表现、实验室检测情况、流脑疫苗接种史等（见《预防接种工作规范》流脑疑似病例个案调查表）。
在辖区内出现首例流脑病例时，县级疾病预防控制机构应对病人所在地的医疗机构开展病例搜索，必要时开展社区病例主动搜索。发生聚集性病例或在学校、集中用工场所中发生病例时，应对其接触密切的人群开展流行病学调查和病例主动搜索等。同时还要了解人群疫苗接种、人口流动、人群发病以及居住环境等情况。
（三）实验室监测
实验室监测包括病原学监测、健康人群带菌监测、免疫水平监测和耐药监测等内容。进行检测工作时应严格遵守《
病原微生物实验室生物安全管理条例》规定。
1、病原学和血清学检测
（1）医疗机构内标本采集和检测
医疗机构发现流脑病例和疑似病例时，无论是否使用抗生素治疗，都要尽快采集病人脑脊液、血液、瘀点（斑）组织液标本，标本要尽可能在使用抗生素治疗前采集。
脑脊液：采集1毫升脑脊液，进行涂片检测、培养分离、抗原检测。
血液：抽取病人全血4毫升，其中1毫升用于分离血清进行抗体测定，其余全血进行病原培养分离、核酸检测。
瘀点（斑）组织液标本：选病人皮肤上的新鲜瘀点（斑），消毒后用针头挑破，挤出组织液，涂片镜检。
开展检测的医疗机构，分别采集2份脑脊液、血液标本，其中1份供自行进行检测用，另1份送县级疾病预防控制机构。不能进行上述检测的医疗机构，只需采集1份标本，并立即报告或将标本送县级疾病预防控制机构。
因脑膜炎双球菌比较脆弱，采集标本后，在运送样品或培养物时，应保持样品温度处于20℃—36℃之间，但检测抗体的血清标本应冷藏运送。
（2）疾病预防控制机构标本检测
县级疾病预防控制机构要主动与医疗机构联系，收集所有流脑病例和疑似病例的脑脊液、血液标本。对于病原检测阴性的病例要采集恢复期血清；对首例流脑病例要采集其密切接触者（预防性服药前）咽拭子标本。
县级疾病预防控制机构应立即（不超过48小时）将标本送市级疾病预防控制机构进行检测。
市级疾病预防控制机构收到病例标本后，及时进行流脑病原检测和血清抗体测定，将分离的菌株或培养阴性的标本及时送省级疾病预防控制机构。
省级疾病预防控制机构收到分离的菌株或培养阴性的标本后，对菌株应及时完成复核鉴定；对培养阴性标本进行特异性核酸PCR检测。菌株应及时送中国疾病预防控制中心。
