（二）防治并重、综合治理。水源保护要与水质处理相结合。按照《
饮用水水源保护区污染防治管理规定》等相关法规的要求，划定供水水源保护区和供水工程管护范围，制定保护办法，特别是加强对水源地周边设置排污口的管理，严格监控化肥、农药的使用，杜绝垃圾和有害物品的堆放，加强禽畜养殖环境管理，严格禁止在饮用水水源保护区内从事网箱、围网等形式的水产养殖活动，防止供水水源受到污染和人为破坏。在地下水水源地周围建设灌溉等各类机井，建设之前要进行科学论证，防止乱打井超采地下水或引起不同含水层水质混合，造成饮用水源的氟砷等有害物质超标。今后建设农村饮用水水源工程，水利、卫生等有关部门要加强咨询和技术指导，涉及防病改水，要听取卫生部门的意见。饮用水水源地附近要严格禁止发展高污染工业，防止和减轻对农村饮用水水源的污染。工业和城镇用水的治污费用（成本加微利），要按照“污染者付费”的原则收取，采取市场机制进行治理。
（三）因地制宜、建管并重。要按照先急后缓、标本兼治、既保证用水安全又节约资金的原则，分类采取有效措施。在研究和制定供水标准时，首先要保证饮用水的水量，有条件的地方，可以同时解决其他生活用水。为了尽快解决饮用水的水质安全并降低工程成本，部分地区的饮用水与其他生活用水可实行分质供水。为保证供水水质和便于管理，有条件的地方尽可能实行集中供水。农村供水基础设施建设要与其他设施建设统筹考虑，距县城、集镇自来水厂较近的农村居民点，可依托已有自来水厂，进行扩建、改建，辐射延伸供水管线，发展自来水。有良好地下水源条件的地方，可建设集中供水井或分户供水井。在农户居住分散的山丘区，可建设分散式供水工程。严重缺乏淡水资源的地方，可建设雨水集蓄工程。对有可能移民的居民点，修建临时性供水设施。各地要建设好农村学校的饮水安全工程，保证学生喝上符合卫生标准的水。
今后在规划、项目审批、工程建设和运行管理方面，要借鉴已建工程的经验教训，完善和制定切实可行、行之有效的管理办法。要进一步加强前期工作，强化项目管理，所有工程项目都要按建设程序审批。将需要解决饮水困难的人数落实到村组或农户，对人数实行名册管理，通过报刊等形式予以公示，县以上水利部门要建立电子档案，实现项目的信息化管理。工程建设前，要在广泛征求群众意见的基础上，明确工程建成后的管理体制和运行机制。精简管理机构，降低管理成本，按成本合理确定用水的收费标准。要建立产权明晰、责权统一、管理到位、有利于工程可持续利用的管理体制、运行机制和社会化服务保障体系。对于建成的饮水工程，要建立验收、跟踪调查和水质监测制度，针对问题及时采取有效措施。
（四）增加投入，加强资金管理。要充分认识农村饮水安全工程建设的重要性，进一步拓宽投入渠道，多方增加投入，安排好与中央投资相配套的资金，省级安排的资金不低于地方配套资金的30％。要引导和组织好受益群众投入人力、物力、财力进行建设。同时要加强资金管理，专款专用，制定和强化监督检查等制度，防止挪用、滞留资金。要大力推广资金报账制、工程施工监理制和工程材料设备集中统一采购的招标投标制，提高投资使用效率和效益。
