项目建议书、可行性研究报告的批复文件，由农业部发展计划司主办，有关行业司局会签，报部领导签发，以农业部文件下达。
第十条 地方及直属直供垦区承担项目的初步设计，中央投资600万元以上（含600万元）的，由农业部行业司局根据项目评估意见，办理批复文件；中央投资在600万元以下的，由各省级人民政府农业行政主管部门审批，同时抄报农业部发展计划司和行业司局。农业部直属单位基本建设项目的初步设计由发展计划司或委托相关部门根据项目评审意见办理批复文件。
农业部初步设计批复文件以办公厅文件下达。
第十一条 基本建设项目一经农业部批准，必须严格按照审批文件执行，不得擅自变更项目建设地点、建设性质、建设单位、建设内容、降低工程（货物）质量、压缩投资规模等。
第十二条 确因客观原因需进行重大变更的项目，应当重新向农业部报批可行性研究报告。有下列情形之一的属重大变更：
（一）变更建设地点的；
（二）变更建设性质的；
（三）变更建设单位的；
（四）变更建设内容、建设标准、建设规模导致项目主要使用（服务）功能发生变化的；
（五）初步设计概算的总投资变更超过立项批复总投资10%以上（含10%）的，或者实施过程中投资变动超过批准的项目总投资10%以上（含10%）的。
第十三条 施工图预算总投资变更超过批准的初步设计概算总投资5%以上的，须向原审批部门重新报批初步设计。
第十四条 有下列情形之一的，须向原审批部门申请批准：
（一）变更建设期限；
（二）变更招标方案；
（三）变更建设内容、建设标准、建设规模，但不属于本规定第十二条第四项情形的；
（四）变更初步设计概算的总投资超过立项批复总投资10%以下的，或者实施过程中投资变动超过批准的项目总投资10%以下的；
（五）其它变更。
第十五条 完成可行性研究报告、初步设计审批的项目，可列入农业部基本建设投资计划，并按项目建设进度下达年度投资。
对农业部利用中央预算内投资安排的建设内容比较简单、中央投资规模小于100万元（不含100万元）的地方和直属直供垦区的项目，可适当简化、合并相关程序。由农业部有关行业司局根据项目申请文件，直接提出项目计划安排意见（要列明具体建设内容和规模），报农业部发展计划司综合平衡后，列入年度投资计划。
