各级环保部门要落实《纲要》的要求，按照法定权限和法定程序实施环境行政行为。环保部门履行法定职责，不仅要遵守环境保护的实体法规定，还要严格遵守行政执法的程序法规定，特别是环境保护的现场检查程序、环境许可和审批程序、环境收费程序、环境处罚程序、环境复议程序以及行政应诉程序、行政赔偿程序、强制执行等程序，并使用国家规范的环境行政执法文书。
环保部门的执法人员要进一步增强文明执法意识，切实保障环境管理相对人和利害关系人依法享有的知情权、陈述权、申辩权和救济请求权，规范环境执法行为，减少环境行政执法的程序性错误。
五、完善监督机制，加强环境行政执法监督
强化行政执法监督，是全面推进依法行政的保障和制约。《纲要》提出，要推行行政执法责任制，建立执法评议考核制和执法过错追究制，并制定环境行政执法绩效评估和奖惩办法。
在总结部分地方试点的基础上，国家环保总局已经总结了环境行政执法责任制“一二三四五”的工作思路，即：贯穿行政执法责任制“一条主线”，实现既要保护公民的合法权益，又要提高行政效率“两个目标”，抓住立好法、学好法、用好法“三个环节”，做到执法主体、执法行为、执法程序和执法形式“四个合法”，确保执法的依据、责任、权限、手段和要求“五个明确”。各地环保部门要继续推行环境行政执法责任制。
在建设项目环境影响评价文件审批、环境保护设施验收、环境执法现场检查、排污收费、环境行政处罚等直接影响相对人权益的环境行政执法环节，各级环保部门要进一步健全对环境行政权力的内部监督制度和制约机制，按照权力与责任挂钩、权力与利益脱钩的要求，实行审批与验收分离、调查与处罚分开、罚款决定与罚款收缴分离、排污收费“收支两条线”，并逐步建立起公开、公平、公正的执法评议考核制和执法过错追究制。
六、加强领导，狠抓落实，切实推进环保部门的依法行政工作
加强领导是全面推进依法行政的组织保证。要进一步强化环境部门依法行政工作的组织领导，并实行部门和内部机构第一责任人负责制。各级环保部门要提出落实《纲要》的五年规划、年度安排和配套措施；环保部门内部各职能机构要结合业务工作，提出落实依法行政的具体措施；各个执法人员要明确其依法行政的岗位责任。要把《纲要》关于依法行政的各项要求，作为环境管理的基本准则，并落实到日常的环境行政监督管理工作之中。
