国防科研实行国家指令性计划下的合同制，也必须积极引入竞争机制。武器装备研制项目应首先按国防科研、生产能力调整后的定点和布局，择优安排、签订合同。具备招标条件的，可按照《武器装备研制项目招标暂行办法》，通过竞争签订合同。预先研究项目，具备条件的也可实行招标。各类国防科研项目招标，主要采用邀请标方式，不面向社会公开招标。
使用部门要会同有关工业部门认真组织好招标工作，严格进行投标资格审查，加强对招标、投标活动的检查监督，确保合同的合理签订。通过招标而定标的国防科研项目，招标方和中标单位，必须以定标方案为基础，进一步协商后签订研制合同。
国防科研单位要按国家规定，实行所长负责制，并逐步推行承包经营责任制。各单位必须优先保证国防科研指令性计划的执行，严格履行依法签订的合同。对国防科研合同，可通过分解以内承包的方式落实到基层，并逐步以竞争、选聘或协商等方式，择优确定承包负责人。其他参加承包的人员，也要从原来的行政组合制逐步改为有组织有领导的聘任制。择优确定承包者和选聘科研人员，要贯彻公开和公平的原则，搞好优化组合，注意新老结合，梯次选配，既出成果，又出人才。
内部承包要根据各单位的实际情况和各类科研活动的特点，采取不同的形式。武器装备研制项目的承包，要在签订合同的基础上，由行政指挥和主管设计师组织，按系统、分系统、单项设备等层次分解，落实到相应的承包单位和人员。承包负责人，一般应与行政指挥和设计师系统的负责人取其一致，以利于加强系统工程管理。预先研究和技术基础研究，要按课题内容落实承包单位和人员。
实行内部承包，必须贯彻责、权、利相结合的原则，制定明确的技术、经济和质量、进度等承包指标，实行目标责任制。各单位实行承包经营责任制，要统筹安排各类科研活动，优先保证国防科研任务，防止短期行为。
三、培养科技人才，创造人才脱颖而出的环境，建立精干的高水平的国防科技队伍
国防科研单位要根据调整后的专业方向、任务和编制定员，通过招标竞争，内部承包，优化组合，改变人浮于事、结构不合理和低效率等状况，逐步建立一支精干的高水平的科技队伍。要制定科技人才培养战略目标，尊重知识，尊重人才，利用技术优势，积极开拓高科技领域，发展技术密集型产业，并注重提高科技队伍的素质，造就中青年科技人才。同时，要组织科技人员，大力开展民用产品，促进人才合理流动，以多种形式参加国民经济建设。
各国科研单位，在保证完成军品任务的前提下，要在国家政策、法律允许的范围内，通过创收积累发展基金，改善工作条件和物质待遇。奖金税的起征点，按照国发〔１９８８〕号文件规定执行。奖金的发放要贯彻按劳分配的原则，按任务和责任确定各类人员奖励等级标准，拉开档次，防止吃大锅饭和平均主义。各级技术带头人的奖金要高于科研人员平均奖，一线科研人员的平均奖要高于一般辅助人员奖金。
