从项目经费中提取５％，由组织协调部门掌握，用于本项目调整计划的安排。
５．根据实际情况，确定试行招标的项目、课题，审批招标结果。
６．根据国家科技成果管理办法，主持重大攻关成果的国家级鉴定。
三、主持部门的工作
重点科技项目的组织管理工作，分别委托国务院归口管理部门负责；跨部门的项目，可由两个或两个以上部门联合主持。联合主持的项目，要有一个指定的部门牵头负总责，和参加主持的部门共同讨论、协商、确定重大问题。主持部门的工作，主要是：
１．根据国家计划，做好所主持的项目、课题的实施论证及总体安排，保证计划考核目标的实现。向组织协调部门提出课题的可行性研究报告。
２．组织有关专家对国家计划所确定的课题进行科学论证，分解攻关任务；在课题经费额度内，确定攻关专题和相应的经费。
３．对试行招标的项目、课题，组织招标，择优支持；将招标结果报组织协调部门审批。
４．根据审定的课题可行性研究报告或招标结果，同承担单位签定攻关专题合同，并报组织协调部门备案。
５．督促、检查合同的执行情况，及时发现、解决问题：根据实际情况，按技术合同法，在规定的经费额度内，停止、撤销或增订同一课题下的专题合同。必要时，可对同一课题的年度合同经费调剂使用。调整年度计划，并将攻关专题的调整意见报组织协调部门审定。
６．审查承担单位的技术总结和经费预决算报告。
７．每年二月底以前，写出上年度科技攻关工作的总结报告，包括合同的进度和经费使用情况，报组织协调部门，并抄送国家计委。
８．根据国家科技成果管理办法，主持攻关成果的部级鉴定。
９．申报需要予以奖励的攻关成果和创造成果的单位、个人。
四、承担单位的工作
各承担单位的工作，主要是：
１．严格执行攻关合同，按规定的内容和进度完成科研任务。
２．合同经费实行包干使用。负责按期偿还应偿还的国家拨款。
３．每年一月底，按合同写出上年度攻关进度和经费使用报告，报主持部门。项目完成后，要作出技术总结和经费决算报告，向主持部门申请鉴定。
五、拨款制度
１．国家拨给重点科技项目的经费，按不同类型实行分类管理、部分偿还的制度，改革过去那种经费由国家拨款包下来，吃“大锅饭”的弊端。攻关专题分作三类：
Ａ类：基础研究和应用基础研究，资源环境、劳动保护、气象科学、医疗卫生、计划生育和优生优育、一部分农业科技项目，以及国家为开拓新兴领域所组织的高技术风险项目，实行国家拨款，无偿支持。
