（三） 水利电力部与财政部对各单位报来的经费建议数字， 根据国家财政情况与水利事业计划概要审核情况，经过综合平衡后，核定经费控制指标。省、自治区、直辖市的经费控制指标，由水利电力部与财政部联合下达，水利电力部直属水利事业单位的经费控制指标，由水利电力部下达。
（四） 各省、自治区、 直辖市水利部门水利事业预算编审程序，按有关规定办理。所编预算草案在报送地方财政部门审批的同时要抄送中国农业银行分行，并逐级汇编报水利电力部，抄报财政部并抄送中国农业银行总行。
水利电力部直属水利事业单位编造的预算草案，报送水利电力部审核汇总后报财政部审批。
编制事业费预算的主要依据是：１．下达的事业计划控制指标；２．下达的事业经费控制指标；３．中央或地方编委批准的编制人数；４．规定的开支标准。
（五） 为了加强经营管理， 合理组织收入，对工程管理机构的预算管理形式，分别实行全额预算管理和差额预算管理。
１．凡由水利部门管理的已经建成的大中型水库闸坝，一般实行差额预算管理，各单位支大于收的差额，应当由主管部门从收大于支的单位进行调剂，不足部分列入预算由国家拨款，多余部分由主管部门作为改善和维修工程之用。如没有收入或收入很少的水库闸坝，可以实行收支全额预算管理。
２．凡由水利部门管理的江河堤防、海塘、海堤、圩垸一般按全额预算管理，预算收入上交国家，预算支出由国家拨款。
（六） 各省、 自治区、直辖市水利部门的水利事业费决算报告，根据有关规定办理。为了掌握地方水利事业预算执行情况，各地方于七月份应将上半年预算执行情况向水利电力部作一次简报（格式另发）。年终决算报告和总结，在报送地方财政部门的同时要抄送中国农业银行分行，并逐级汇编报水利电力部、财政部，抄送中国农业银行总行。
水利电力部直属水利事业单位，应按照规定编送月份、季度会计报表，年终报送年度决算报告和总结。季报、年报应附送财务情况说明书，对预算执行情况作系统的分析。
（七）各级水利部门应会同财部政、银行部门对所属事业单位进行定期或不定期检查，及时总结经验教训，不断提高财务管理水平。在检查过程中，如发现有贪污盗窃、挪用、浪费等违反财政纪律的情况，应及时给予严肃处理，以保护国家财产不受侵犯。
