以产业需求为导向，按照产业发展的内在规律，合理配置遗传育种、栽培与养殖、病虫害防治、营养、产后处理与加工、设施设备和产业经济等各个环节的科技资源和研发力量，为产业发展提供全面系统的技术支撑；合理配置种植、畜牧、水产等产业间和区域间的科技资源和研发力量，促进各产业的协调发展，形成条块结合，稳定、持续和高效的现代农业产业技术体系。
（三）强化制度设计，建立内在机制
现代农业产业技术体系要从各个产业发展的整体性出发，在内容设计、任务分解、协作方式和组织管理等方面做好系统化、制度化设计，确保决策、执行和监督三个层面权责明晰、相互制约、相互协作；通过基地、人才、项目相结合，产学研相结合，政府与市场相结合，建立规范化、标准化的管理和运行机制。
（四）稳定经费渠道，提高资金效益
按照产业发展和技术进步规律的要求，在明确中央和地方以及依托单位投入责任的基础上，建立相对稳定的经费支持渠道。加强与国家科技计划（专项）、产业基地建设、地方政府和依托单位资金等的有机衔接，避免重复交叉，提高资金使用效益。
二、任务、结构和职责
现代农业产业技术体系的基本任务是：围绕产业发展需求，集聚优质资源，进行共性技术和关键技术研究、集成、试验和示范；收集、分析农产品的产业及其技术发展动态与信息，系统开展产业技术发展规划和产业经济政策研究，为政府决策提供咨询，向社会提供信息服务；开展技术示范和技术服务。
现代农业产业技术体系由产业技术研发中心和综合试验站二个层级构成。
针对每一个农产品，设置一个国家产业技术研发中心和一个首席科学家岗位。每一个国家产业技术研发中心由若干功能研究室组成，每个功能研究室设一个研究室主任岗位和若干个研究岗位。 其主要职能是：从事产业技术发展需要的基础性工作；开展关键和共性技术攻关与集成，解决国家和区域的产业技术发展的重要问题；开展产业技术人员培训；收集、监测和分析产业发展动态与信息；开展产业政策的研究与咨询；组织相关学术活动；监管功能研究室和综合试验站的运行。
根据每一个农产品的区域生态特征、市场特色等因素，在主产区设立若干综合试验站，每个综合试验站设一个试验站站长岗位。其主要职能是：开展产业综合集成技术的试验、示范；培训技术推广人员和科技示范户，开展技术服务；调查、收集生产实际问题与技术需求信息，监测分析疫情、灾情等动态变化并协助处理相关问题。
