第四条 “985工程”专项资金的管理原则：总体规划，分年实施；集中使用，突出重点；项目管理，绩效考评。
第五条 “985工程”项目学校要按照国家有关财经法律法规和本办法的规定，科学合理编制“985工程”专项资金年度预算，对专项资金实施统一管理、集中核算，保证专款专用，推动项目的顺利实施和预算的及时执行。
第六条 凡使用“985工程”专项资金形成的资产均属国有资产，应纳入学校资产统一管理，合理使用，精心维护。
第二章 预算管理
第七条 财政部、教育部根据“985工程”建设目标、任务以及项目学校在优秀人才、重点学科、科研能力等方面的优势，结合“985工程”二期建设水平和成效，遵循公平、公正、公开的原则，并建立政府决策与专家咨询相结合的管理机制，主要按因素法确定并下达项目学校各阶段中央财政专项资金基本额度预算控制数。同时，预留一部分资金，根据“985工程”项目学校年度预算执行情况以及项目实施绩效等情况，统筹安排。
第八条 项目学校根据《
国家中长期教育改革和发展规划纲要（2010-2020年）》精神和加快推进世界一流大学和高水平大学建设的指导思想、建设目标和主要任务，结合学校的发展战略规划、中央财政专项资金基本额度预算控制数、其他渠道建设资金等情况，在科学、充分论证的基础上，研究制订学校继续实施“985工程”总体规划（2010-2020年）和改革方案，报教育部、财政部审批。
第九条 从2011年起，财政部原则上于每年8月初下达项目学校下一年度“985工程”专项资金预算控制数。项目学校结合“985工程”总体规划（2010-2020年）和改革方案，按照本办法的规定，编制下一年度项目预算，经主管部门审核后，在9月20日前报送财政部。财政部对学校项目预算进行审核后，纳入下一年度部门预算。
第十条 “985工程”专项资金项目预算纳入学校年度预算，统筹实施。
第十一条 “985工程”专项资金预算一经批准，必须严格执行，一般不作调整。确有必要调整时，应按规定程序报批。
