另外，１９９０年１２月，和田地区物价检查所对该地区６县１市的９个棉花经营单位１９８８年度收购棉花过程中发生的升溢款９０万余元，根据国家物价局、国家技术监督局（１９８８）价检字７４３号文件和《
价格管理条例》的规定，予以没收，上缴地区财政。策勒、洛浦等县税务局对物价检查所的决定提出异议，认为对棉花升溢款的处理应执行国家税务局国税发（１９９０）２０５号文件，数家棉花经营单位也要求执行国家税务局的文件，向法院提起诉讼。
二、上述案件涉及的有关规章的内容
上述两类案件的实质是对棉花收购过程中发生的升溢款如何处理的问题，对此，税收法规和物价法规均未作具体规定，而税收规章和物价规章对此问题却各自作了不同的规定，相互冲突。
对棉花升溢款如何处理的问题，作出有关规定的规章有：国家税务局国税发（１９９０）２０５号文件；商业部（１９８６）商棉字第１号批复；国家物价局、国家技术监督局（１９８８）价检字７４３号文件和国家物价局、国家技术监督局、商业部、纺织部（１９９０）价检字２５０号文件。其主要内容是：
商业部（８６）商棉字第１号给河北省供销合作联合社的批复中规定：“对基层检验环节的技术考核，按收购棉花的总金额计算，盈亏相抵后净盈或净亏不能超过０．３％。在规定幅度以内的，视为执行价格政策正常。凡有帐可查、有户可找的升溢部分应退还给棉农，亏损部分也应向棉农收回。升溢部分超过３‰无法退还的部分要挂帐，留待下年抵补亏损用。如果下一年度仍有升溢，应将上年的升溢报告当地政府，作为供销社用于棉花生产的支农资金，不能挪作他用”。
国家物价局、国家技术监督局（１９８８）价检字７４３号文件规定：“按收购棉花总金额计算，盈亏相抵后，净盈或净亏的幅度最高不超过５‰。超过允差幅度的净盈金额，应退还给棉农”。“无法退还农民或用户的非法所得，统一由物价检查机构收缴国库”。
国家物价局、国家技术监督局、商业部、纺织部（１９９０）价检字２５０号文件规定：“经济盈亏：按收购棉花总金额计算，盈亏相抵后，净盈或净亏的幅度最高不超过３‰。超过以上幅度的，视为抬级、抬秤或压级、压秤收购”。“对压级、压价收购的，应责令其将非法所得退还给棉农，并按
国家物价局《关于价格违法行为的处罚规定》第
六条、第
七条进行处罚。”“无法退还农民、经营单位或用户的非法所得，统一由物价检查机构收缴国库。”
